شبیه سازی ذخیره سازی یک پپتید (یا پروتئین) در نانولوله کربنی با لمپس در مورد fix deform شبیه سازی پلی اتیلن با پتانسیل REBO با

این آموزش که از سری آموزشهای بیوفیزیک می باشد، به بررسی و شبیه سازی ذخیره سازی یک پپتید و یا یک پروتئین در نانولوله کربنی می پردازد. این کار بر اساس یک مقاله سال ۲۰۰۹ از مجله ‌Biomaterials می باشد. این مقاله از این لینک قابل دانلود می باشد. نمودارهای ۱ و ۵ این مقاله در این شبیه سازی بازتولید می شود. توضیحاتی در باره دارورسانی هوشمند drug-delivery ارایه می شود. همه فایلها در هنگام خر ...

در این آموزش دستور مربوط به fix deform رو توضیح دادم. سعی کردم روی گرافن همه پارامترهاش رو توضیح بدم. مدت زمان آموزش 70 دقیقه. تاریخ انتشار : بهمن 97 ...

توی پتانسیل های لمپس پارامترهای برهمکنش ترسوف tersoff کربن وجود دارد. برای ژرمانیوم هم وجود دارد. ولی پارامترهای برهمکنش ترسوف بین کربن و ژرمانیوم موجود نیست. در این آموزش نحوه بدست آوردن برهمکنش ترسوف بین کربن و ژرمانیوم را توضیح می دهیم. شما می توانید از این برهمکنش در مقالات خود استفاده کنید. بعلاوه در این آموزش نگاهی ریز به خود پتانسیل ترسوف خواهیم داشت و یک برنامه پایتون در اختیار شما قرار می ...

در این آموزش، شما یاد میگیرید که از طریق google schoolar alert چگونه برای خودتون alert ایجاد کنید و از طریق آن هر روز ایمیل هایی حاوی عناوین آخرین مقالات ISI به ایمیل شما بیاید. با این کار همیشه خود را بروز نگه می دارید و می توانید مسیر پژوهشی خود را تعیین کنید. آموزش در مدت 5 دقیقه انجام شده است. انتشار آذر ماه 97 ...

در این آموزش شما یاد میگیرید چگونه یک جعبه پلی اتیلن شامل 50 ملکول با چگالی 0.857gr/cm3 با استفاده از پکمول ایجاد کنید و سپس از خروجی پکمول کمک گرفته و با استفاده از VMD یک دیتا فایل ایجاد کنید. برهمکنش بین اتمهای موجود در سیستم (هیدروژن و کربن) با پتانسیل REBO مدل می کنیم. این شبیه سازی با استفاده از نرم افزار لمپس انجام شده است. هیچ محاسبه ای رو این سیستم انجام نداده ام. یک بحثی هم برای نما ...